定義
理事會乃由本會會員組成，為本會行政機關，負責執行由全體會員大會議決之議案，以及推行本會之一切活動。
組織
本會最少三位理事，包括會長、副會長和負責財政職務之理事，另外設有負責以下職務，包括行政、公關、資訊及統籌等之理事。而人數或職銜方面可應本會的情況由會員大會決議。職銜方面可以增減或兼任。
委任任期及薪酬
所有理事均由每年舉行之會員大會選出並委任。任期二年，經會員大會選出可獲連任。所有理事會會員乃義務性質，各理事不能收取薪酬或利用本會之活動從中收取利益。2015-2017年度第五屆理事會名單
會長
洪雙雙醫師(畢業年份:2008)
副會長
張宇昊醫師(畢業年份:2013)
吳文玲醫師(畢業年份:2014)
司庫
林宗冠醫師(畢業年份:2012)
秘書長
潘念龍醫師(畢業年份:2013)
理事
潘任釧醫師(畢業年份:2007)
呂兆陞醫師(畢業年份:2007)
林志恒醫師(畢業年份:2011)
周卓能醫師(畢業年份:2014)